Szkoła ponadpodstawowa kształcąca młodzież niepełnosprawną intelektualnie w stopniu umiarkowanym, znacznym i niepełnosprawnościami sprzężonymi. Zajęcia mają na celu usamodzielnienie uczniów i przygotowanie do jak najlepszego funkcjonowania w  codziennym życiu.
Uczniowie kształcą się m.in. w zakresie: przygotowywania posiłków, szycia, prac porządkowych, prania, ogrodnictwa, korzystania z komputera i urzadzeń biurowych, technik plastycznych i użytkowych, elementy prac stolarskich.

W procesie kształcenia uczniów wyodrębnia się zajęcia edukacyjne:

• funkcjonowanie osobiste i społeczne,
• wychowanie fizyczne,
• przysposobienie do pracy,
• zajęcia rewalidacyjne,
• zajęcia kształtujące kreatywność,
• zajęcia rozwijające komunikowanie się.

Kształcenie uczniów w szkole jest zindywidualizowane, dostosowane do ich potrzeb edukacyjnych oraz możliwości psychofizycznych.
Budynek szkoły objęty jest monitoringiem. W szkole pracuje wykwalifikowana kadra. Uczniowie są pod stałą opieką pedagogów i psychologa szkolnego, logopedów.
Przy szkole działa Internat, który oferuje opiekę od poniedziałku do piątku.
ZS 16 posiada certyfikat Szkoły z Klasą, brał udział m.in. w akcji Bezpieczna Szkoła, od lat realizuje projekty unijne m.in. eTwinning, Erasmus, Comenius, Wolontariat Europejski - młodzież, oprócz edukacji międzykulturowej, poznaje nowoczesne technologie multimedialne.

Młodzież bierze udział w licznych konkursach, odnoszą sukcesy na zawodach sportowych, działający w szkole teatr zdobył liczne nagrody.
Zajęcia pozalekcyjne to m.in. zajęcia sportowo-rekreacyjne (siłownia, aerobik, zajęcia na basenie), zajęcia teatralne, taneczne, warsztaty filmowe, plastyczne, zajęcia informatyczne, wokalne, muzyczne. W szkole działa koło krajoznawczo – turystyczne organizujące rajdy i wycieczki.
Organizujemy bale karnawałowe, ogniska, wyjścia do kina, teatru, spotkania i imprezy integracyjne. Organizujemy również różnorodne zajęcia i warsztaty dla rodziców i opiekunów naszych uczniów.

Szkoła współpracuje z Fundacją Aktywizacja, Centrum Aktywizacji Zawodowej Osób Niepełnosprawnych w Białymstoku, realizuje projekty w ramach doradztwa zawodowego dla osób z orzeczeniami o stopniu niepełnosprawności umiarkowanej i znacznej, Lokalnym Centrum Doradztwa Zawodowego w CKU w Białymstoku, z Powiatowym Urzędem Pracy i trenerami pracy osób niepełnosprawnych.